自2015年10月12日起，所有簽證申請人在申請申根簽證時將被要求提供生物識別數(shù)據(jù)（十指指紋和一張數(shù)碼照片）。該程序簡單快捷，僅需幾分鐘時間。

申請申根簽證的申請人必須親自前往領(lǐng)事館或外部簽證服務(wù)處提交申請。生物識別數(shù)據(jù)和申根簽證申請表格中提交的數(shù)據(jù)將被記錄于簽證信息系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫中，并保留五年。在此期間內(nèi)的后續(xù)申請中，多次前往申根地區(qū)的旅客將無需重復(fù)指紋錄入步驟，指紋可直接從簽證信息系統(tǒng)中的過往申請文件復(fù)制。

簽證信息系統(tǒng)將包含所有申根簽證申請信息及任一申根國領(lǐng)事館針對簽證申請所作出的決定信息。這將簡化簽證申請流程、加強(qiáng)歐盟外部邊界檢查、提升安全等級。對生物識別技術(shù)的使用將保護(hù)簽證申請人，更好地打擊身份盜用、防止身份造假，而身份盜用與造假在某些情況下會導(dǎo)致有權(quán)進(jìn)入申根區(qū)的人士遭到拒簽或被拒入境。同時，這將使得對過往簽證信息及申請人旅行記錄的合法使用變得更加容易（如，申請人申請多次入境簽證時）。

有限數(shù)量的申請人可免于錄入指紋，包括12歲以下兒童和身體條件不允許指紋錄入的人。

該簽證信息系統(tǒng)自2011年啟用，在全球漸進(jìn)式推行。該系統(tǒng)在中國開始使用的當(dāng)天，簽證信息系統(tǒng)也將同時在申根國駐東亞國家的所有領(lǐng)事館投入使用。